影片延续了X战警系列的核心矛盾，将变种人与人类社会的冲突推向顶峰。一种号称能“治愈”变种能力的发明，看似提供了和平共处的希望，实则引发了更深的伦理危机与族群撕裂。以万磁王为首的激进派变种人兄弟会，誓要摧毁这项技术及其背后的势力，捍卫变种人生存权。而X教授领导的X战警则在维护和平与保护同胞间艰难抉择。故事的最大变数在于，此前被认为已牺牲的琴·葛雷并未真正死去，她体内被压抑的终极力量——凤凰之力——彻底爆发。这股不受控制的混沌力量，使她成为超越阵营对立的、足以毁灭一切的存在。影片汇聚了金刚狼、风暴女、镭射眼等经典角色，动作场面全面升级。最终，所有势力不得不面对同一个毁灭性的敌人，在旧金山展开决战，个人的牺牲与种族的未来在此刻交织，结局将永久改变变种人的世界格局。