西历2314年，世界在经历与变革者利翁兹·奥马克的决战以及A-Laws解体后，迎来了表面的和平。然而，和平的表象之下，消失于公众视野的“天人”组织仍在暗中活动，持续监视着可能引发战争的火种。此时，地球圈侦测到来自木星方向的未知加密对话。刹那·F·清英驾驶能天使高达修复型前往调查，却遭遇了神秘的地外金属生命体“ELS”。这种拥有同化与进化能力的生命体跨越1200万光年的距离而来，其接触对地球文明构成了前所未有的生存威胁。面对无法用常规战争手段沟通的敌人，刹那与天人成员们必须超越单纯的战斗，寻求理解与对话的可能。这场冲突将考验人类与变革者之间的纽带，也将决定两个文明未来的命运。