《终末的后宫》是一部设定在近未来的科幻动画。故事主角怜人因罕见疾病接受冷冻睡眠，原计划短暂治疗，却意外沉睡了五年。当他醒来时，世界已面目全非：一种神秘的MK病毒导致全球99.9%的男性死亡，人类社会结构彻底崩塌，形成了一个几乎全是女性的世界。作为极少数对病毒免疫的男性幸存者，怜人被赋予了一项重大使命——成为延续人类种族的“种马”。然而，他的内心始终无法忘却沉睡前的青梅竹马绘理沙，以及与她重逢的约定。剧情围绕怜人被迫进入由国家管理的设施，与多位被选中的女性互动，展开一系列关于繁衍的任务。作品深入探讨了在这种极端人口失衡背景下产生的社会伦理、个人情感与人性的冲突。怜人在履行所谓“责任”的同时，不断挣扎于对过去的忠诚与眼前的现实之间。动画融合了科幻、悬疑和情感元素，描绘了一个在灾难后重建的世界中，关于生存、爱与选择的复杂故事。